工程研究中心以四川大学为依托，实行中心主任负责制，工程技术委员会审议有关工程技术研究开发工作计划，中心主任对管理委员会负责，各平台对中心主任负责，同时健全组织机构，建立工作流程，完善管理制度。

    工程研究中心在技术委员会领导下，以项目开发为纽带，通过产学研用合作、同国内科研院所开展多种形式的合作，强化工程研究中心的运行，同时为国内高等院校和工程单位培养及输送人才。通过采用灵活多变的激励机制，推行创新奖励，强化绩效考核，充分调动工程研究中心研发人员积极性，并形成竞争、开放、流动的人才机制，不断优化工程研究中心人员结构。